Burundin johtava perinteinen symboli oli muinainen rumpu, Karyenda, jolla oli puolijohdetila. Pelkästään mwami (”hallitsija”) pystyi tulkitsemaan Karyendan viestit ja muuttamaan ne yhteiskuntaa hallitseviksi säännöiksi. Karyenda valittiin siten kansallisen lipun symboliksi Burundin noustessa Belgian siirtomaavallasta. Näytettiin myös durrakasvi, joka edustaa Burundin päätuotetta. Rumpu ja kasvi ilmestyivät mwamin valtuuttaman lipun keskimmäiselle valkoiselle levylle 30. maaliskuuta 1962 ja nostettiin 1. heinäkuuta, kun itsenäisyys saavutettiin.
Lipputaustaan sisältyy valkoinen saltire, muotoiluidea, joka on saattanut lainata Belgiasta (Espanjan Alankomaat), jonka Burgundian risti oli yleinen lippuaihe 1500-luvulta. Salreenin ja keskilevyn valkoinen väri symboloi rauhaa. Loput alueet olivat punaisia itsenäisyystaistelua ja kansakunnan kärsimyksiä varten ja vihreät tulevaisuuden kehitykseen kohdistuvien toivojen suhteen. Monarkian kaatamisen jälkeen marraskuussa 1966 Karyenda poistettiin lipusta. Uusi malli, viimeksi vahvistettu 27. syyskuuta 1982 annetulla asetuksella, tuli viralliseksi 28. kesäkuuta 1967. Kolme kuuden terävän punaisen tähden vihreää reunaa vastaavat kansallista tunnuslausetta: "Yhtenäisyys, työ, edistyminen". Monille he kuitenkin epäilemättä muistavat Burundin kolme pää etnistä ryhmää - tutsit, hutu ja twa - sekä uskollisuuden, jonka burundilaiset kerran lupautuivat jumalalleen, kuninkaalleen ja maalleen.
