Kootenay River, myös speltti Kootenai, virta Länsi-Pohjois-Amerikassa, nousee kalliovuorilla länteen Banffista, Altasta, Can. Se virtaa etelään Kootenayn kansallispuiston läpi Brittiläisessä Kolumbiassa, Kanadassa, purkautuen kallioista virtaamaan yleensä etelään Kalliovuoren kaivoon. Se kääntyy etelään Montanaan, Yhdysvaltoihin, leveässä U-muotoisessa silmukassa ja sitten pohjoiseen Idahoan ja takaisin Kanadaan ennen laajentumista pitkäksi, kapeaksi Kootenay-järveksi Brittiläisessä Kolumbiassa; järven länsivarresta se virtaa Columbiajokeen Castlegarissa.
Noin 130 mailia (210 km) 485 mailin (780 km) pituisesta joesta on Yhdysvalloissa. Kootenay putoaa 365 jalkaa (111 m) 40 km: n päässä Kootenay-järven ja Columbia-joen välillä. Tässä osassa useat padot toimittavat virtaa perusmetallisulattimeen ja jalostamoon Trailissä, BC. Joki on kuljetettava Bonners Ferrystä, Idaho, Nelsoniin, BC.
Brittiläinen turkista kauppias David Thompson tutki vuonna 1807 ja nimeltään Flat Bow joutui Kootenayn nimensä intialaisesta sanasta, joka tarkoittaa ”vesikansoja”.
