Putrajaya, Malesian kaupunki ja liittovaltion alue, joka sijaitsee Malesian länsi-keskiosassa. Se sijaitsee pääkaupungista Kuala Lumpurista 15 mailia (25 km) etelään ja toimii maan hallinnollisena keskuksena.
Ennen Putrajayan rakentamista Malesian hallintovirastot olivat eri puolilla Kuala Lumpuria. Liikenteen ruuhkien kasvaessa toimistojen välinen etäisyys alkoi kuitenkin haitata hallintoprosesseja. Tämän seurauksena hallitus päätti perustaa uuden kaupungin, jossa hajautetut toimistot voitaisiin siirtää ja koota uudelleen tehokkaamman hallintokeskuksen muodostamiseksi.
Pääministerin kabinetti muutti Putrajayaan vuonna 1999. Kuala Lumpur toimi edelleen Malesian pääkaupungina - se oli parlamentin molemmat talot ja ensimmäinen kuninkaallinen palatsi - ja Putrajaya laajeni vähitellen liittämällä siihen liittovaltion tuomioistuin, toinen kuninkaallinen palatsi ja monia muita hallinnollisia rakennuksia. Se julistettiin liittovaltion alueeksi vuonna 2001.
Putrajayaa johtaa yrityselin, joka ohjaa sen kehitystä. Putrajaya rakennettiin entisille kumi- ja öljypalmuistutusalueille, ja siitä kehitettiin ”puutarhakaupunki”. Siinä on laaja, mutkitteleva ihmisen tekemä järvi ja monia puistoihin, kasvitieteellisiin puutarhoihin ja kosteikkoihin omistettuja alueita. Putran moskeija (Masjid Putra), järven rannalla lähellä pääministerin kabinettia, avattiin vuonna 1999. Kaupunki suunniteltiin alusta alkaen osaa kasvavaan korkean teknologian viestinnän tutkimus- ja kehityskäytävään, joka ulottuu etelään Kuala Lumpurista. Putrajayaan pääsee lukuisilla rautateillä ja moottoriteillä, ja se on Kuala Lumpurin kansainvälisen lentokentän välittömässä läheisyydessä. Pop. (2010) 72 413.
