Tsaari Pietari I Suuri oli kunnianhimoinen suunnitelma muuttaa Venäjä nykyaikaiseksi valtioksi. Venäjän laivaston rakentaminen oli osa kyseistä ohjelmaa, ja hän vieraili Alankomaissa oppiakseen edistyneimmistä laivanrakennuskonsepteista ja tekniikoista. Kauppalaivoille vuonna 1699 valitsemansa lipun heijasti Alankomaiden puna-valko-sinistä kolmiväriä: Venäjän lippu erottui vain siitä, että raidat oli järjestetty valko-sini-punaisiksi. Näille väreille annetaan joskus perinteistä venäläistä symboliikkaa - yksi tällainen tulkinta muistuttaa Moskovan suuriruhtinaskunnan punaista kilpiä, joka edustaa Pyhän Georgian sinisellä peitetyllä ja valkoiselle hevoselle kiinnitettyä kuvaa. Viitattiin myös valkoisen ja punaisen neljäsosan lippuun sinisellä ristillä, joka oli lentänyt 1667 Oryolille, ensimmäiselle Venäjän sota-alukselle. Uusi lippu tuli erittäin suosituksi niin paljon, että 1800-luvulla musta-oranssi-valkoinen kolmivärinen, jonka tsaarit yrittivät asettaa kansallisena lipuna maalle, epäonnistuivat ja lopulta hylättiin. Juuri ensimmäisen maailmansodan alkamisen jälkeen lippua muokattiin lisäämällä kultakeltainen kantoni, jossa oli keisarilliset aseet, mikä merkitsee hallitsevan dynastian ja Venäjän kansan yhteisvastuullisuutta.
Neuvostoliiton aikana kaikki Venäjän liput perustuivat Punaiseen banderoliin, jonka juuret olivat Ranskan vallankumous ja mahdollisesti jopa aikaisemmat talonpojan kapinan nousut. Neuvostoliiton muodostumisen jälkeen virallisessa valtion lipussa oli kullan vasara, sirppi ja kullan reunalla oleva punainen tähti nostin yläkulmassa. Neuvostoliiton hajoamisen yhteydessä sen symbolit korvattiin. Tsaarien ja kommunistien johtajien hankkimat muut kuin Venäjän alueet itsenäistyivät, ja Venäjän federaatio, joka pysyi edelleen, otti käyttöön valko-sinipunaisen Venäjän kansallisen lipun. Siitä tuli virallinen 21. elokuuta 1991, neljä kuukautta ennen Neuvostoliiton virallista hajoamista. Se on nyt laajalti hyväksytty, vaikka muutama ryhmä kannattaa punaisen bannerin käyttöä tai jopa mustan-oranssi-valkoisen kolmivärin omaksumista.
