J. Edgar Thomson (syntynyt 10. helmikuuta 1808, Springfield Township, pa., Yhdysvallat - kuollut 27. toukokuuta 1874, Philadelphia), amerikkalainen rakennusinsinööri ja Pennsylvania Railroad Company -yrityksen presidentti, joka yhdisti rautatieverkon Philadelphiasta eri puolilla Länsi- ja Etelä-kaupunkeja, jotka ulottuvat Chicagoon ja Norfolkiin, Va.
Thomson liittyi Pennsylvanian insinööritoimitusyksikköön kello 19. Tuolloin joukot kartoittivat radan parhaan kulun Philadelphiasta Columbiaan. Vuonna 1830 hänestä tuli Camden & Amboy Railroad -tekniikan osaston päällikkö New Jerseyssä. Vuodesta 1832 vuoteen 1847 hän oli pääinsinööri Georgian rautatieyhtiölle, joka rakensi Atlanta-Augusta-linjan, pisin linja, jonka yksi yritys oli tuolloin rakentanut.
Vuonna 1846 Pennsylvanian rautatieyhtiölle annettiin tehtäväksi rakentaa rautatiejärjestelmä, joka mahdollistaisi Pennsylvanian kilpailla New Yorkin ja muiden itäisten osavaltioiden kanssa liikenteessä länteen. Hänet palkattiin rautateiden pääinsinööriksi vuonna 1847. Hän oli presidentti vuoteen 1852 mennessä ja hän toimi tässä tehtävässä kuolemaansa asti. Valitsemalla tarkan reitin ja hevosenkengän käyrän sijainnin, Thomson suoritti läpikulun, joka ylitti Allergeenit ja Appalachit käyttämättä taipuvaisia asteita. Linjan Philadelphia-Pittsburgh -palvelu alkoi helmikuussa 1854.
Seuraavan 20 vuoden aikana Thomson jatkoi linjaa länteen luomalla Pennsylvania Company vuosina 1870–71 vuokraamaan ja kehittämään järjestelmiä Pittsburghista Chicagoon. Hän työnsi myös itään ja etelään, vuokraamalla New Jerseyn yhdistyneiden yhtiöiden linjat vuonna 1871 ja hankkimalla osuuden eteläisen rautatieyrityksen turvayhtiöstä vuonna 1873. Philadelphian perustamiseksi transatlanttisen kaupan keskukseksi hän auttoi perustamaan amerikkalaisen höyrylaivayhtiön 1870.
Pennsylvania Railroad -linjojen huomattavan laajentamisen lisäksi Thomson esitteli useita parannuksia rautatiealalla, mukaan lukien matkustajalaukkujen käsittelyjärjestelmän ja teräksen käytön rautakaiteiden sijasta.
