Yahya Khan, kokonaisuudessaan Agha Mohammad Yahya Khan, (syntynyt 4. helmikuuta 1917, lähellä Peshawaria, Intia [nyt Pakistanissa] - kuollut 10. elokuuta 1980, Rawalpindi, Pakistan), Pakistanin presidentti (1969–71), ammatillinen sotilas josta tuli Pakistanin asevoimien päällikkö vuonna 1966.
Yahya syntyi perheelle, joka oli peräisin Persian hallitsijan Nāder Shahin eliitti-sotilasluokasta, joka valloitti Delhin 1700-luvulla. Hän sai koulutuksen Punjabin yliopistossa ja valmistui myöhemmin ensin luokkaansa Intian sotaakatemiassa Dehra Dunissa. Hän palveli Italiassa ja Lähi-idässä toisen maailmansodan aikana ja järjesti Intian jakamisen jälkeen vuonna 1947 Pakistanin henkilöstökoulun.
Palveltuaan sodassa Intian kanssa Kashmirin alueella, hänestä tuli Pakistanin nuorin prikaatin kenraali 34-vuotiaana ja sen nuorin kenraali 40-vuotiaana. Hänestä tuli päällikkökomentaja vuonna 1966. Presin suostumus. Mohammad Ayub Khan, Yahya oli armeijan komennossa, kun maassa puhkesi katumääriä. Ayub kehotti häntä ottamaan haltuunsa hallituksen ohjeet ja säilyttämään Pakistanin koskemattomuuden. Hänet nimitettiin sotalain päävalvojaksi, jonka hän julisti sanoilla ”En suvaitse häiriöitä. Anna jokaisen palaa virkaansa."
Yahya Khan seurasi Ayub Khania presidenttinä, kun tämä erottui tehtävästään maaliskuussa 1969. Vuonna 1971 puhkesi vakavasta konfliktista, joka oli silloisen Itä-Pakistanin keskushallinnon ja Awami-puolueen välillä, jota johti Sheikh Mujibur Rahman. Itä-Pakistanin johtaja vaati autonomiaa puolueelleen maantieteellisesti jakautuneesta maasta, ja Yahya Khan vastasi määräämällä armeijan tukahduttamaan Awami-puolueen. Hänen määräystensä raa'isuus, jonka seurauksena miljoonat itäpakistanilaiset pakolaiset saapuivat Intiaan, johtivat Intian hyökkäykseen Itä-Pakistaniin ja sen Länsi-Pakistanin miehittäjien reittiin. Itä-Pakistanista tuli Bangladeshin itsenäinen maa, ja häviöllään Yahya Khan erosi (20. joulukuuta 1971).
Hänen tilalleen ulkoministeri Zulfikar Ali Bhutto asetti hänet kotiarestiin. Pian sen jälkeen hän halvasi aivohalvauksen, ja vapautumisensa jälkeen hänellä ei ollut enää merkittävää poliittista roolia.
