Toisen maailmansodan jälkeen perustetun Yhdistyneiden Kansakuntien edustusjärjestelmän puitteissa ranskalaisilla oli velvollisuus siirtää Togo itsehallintoon. Paikallinen lippu hyväksyttiin vuonna 1956, vähän ennen kuin maasta tehtiin autonominen tasavalta Ranskan unionissa. Lippun vihreä tausta merkitsi maataloutta, toivoa ja nuorta; ranskalainen trikoloori nostin yläkulmassa muistutti ranskalaista ylivaltaa. Kaksi keltaista viiden kärjen tähteä, jotka on sijoitettu kuvitteelliseen diagonaaliseen linjaan, joka kulkee ala-nostimesta ylempään kärkeen, viittasivat eteläisen rannikon tasangoihin ja pohjoisen savanneihin, "yhdistyneinä järjestyksen ja työn rakkaudessa".
27. huhtikuuta 1960 Togo itsenäistyi täysin uuden lipun alla; se alensi kaksi tähteä yhdeksi korostaakseen kansallista yhtenäisyyttä. Lippun viisi vihreää ja keltaista raitaa vastaavat maan hallinnollisia alueita, kun taas nämä värit ovat muistutus siitä, että valtaosa väestöstä on riippuvainen maasta, jota se tarvitsee ylläpitää (vihreä) ja omasta kehitystyöstään (keltainen). Punaisen kantonin sanotaan edustavan rakkautta, uskollisuutta ja rakkautta, kun taas valkoinen tähti liittyy puhtauteen. Useat muut maat, jotka saivat itsenäisyyden pian ennen Togoa tai sen jälkeen, valitsivat samat yleisafrikkalaiset puna-kelta-vihreät värit.
